- Абиотические формы азотфиксации
- Электрические бури
- Сжигает ископаемое топливо
- Сжигание биомассы
- Выбросы азота в результате эрозии почвы и выветривания горных пород
- Биотические формы азотфиксации
- Свободноживущие или симбиотические микроорганизмы
- Механизмы поддержания активности нитрогеназной системы
- Биотическая азотфиксация свободноживущими микроорганизмами
- Энергия, необходимая для реакции N-фиксации
- Ферментный комплекс нитрогеназа и кислород
- Биотическая азотфиксация микроорганизмами симбиотической жизни с растениями
- Rhizocenosis
- Симбиотические цианобактерии
- Endorhizobiosis
- Ссылки
Азотфиксации являются совокупностью биологических и являющегося - биологических процессов , которые производят химические формы азота , доступные для живых существ. Доступность азота во многом контролирует функционирование экосистем и глобальную биогеохимию, поскольку азот является фактором, ограничивающим чистую первичную продуктивность в наземных и водных экосистемах.
В тканях живых организмов азот входит в состав аминокислот, единиц структурных и функциональных белков, таких как ферменты. Это также важный химический элемент в составе нуклеиновых кислот и хлорофилла.
Кроме того, биогеохимические реакции восстановления углерода (фотосинтез) и окисления углерода (дыхание) происходят при посредничестве азотсодержащих ферментов, поскольку они являются белками.
В химических реакциях биогеохимического цикла азота этот элемент меняет свою степень окисления с нуля в N 2, до 3- в NH 3 , 3+ в NO 2 - и NH 4 + и до 5+ в NO 3 - .
Некоторые микроорганизмы используют энергию, генерируемую в этих реакциях восстановления оксида азота, и используют ее в своих метаболических процессах. Именно эти микробные реакции коллективно управляют глобальным круговоротом азота.
Самая распространенная химическая форма азота на планете - это газообразный двухатомный молекулярный азот N 2 , который составляет 79% атмосферы Земли.
Это также наименее реактивная химическая форма азота, практически инертная, очень стабильная из-за тройной связи, которая соединяет оба атома. По этой причине обильный азот в атмосфере недоступен для подавляющего большинства живых существ.
Азот в химических формах, доступных живым существам, получается путем «азотфиксации». Фиксация азота может происходить двумя основными способами: абиотическими формами фиксации и биотическими формами фиксации.
Абиотические формы азотфиксации
Электрические бури
Рисунок 2. Гроза Источник: pixabay.com
Молния или «молния», возникающая во время грозы, - это не просто шум и свет; это мощный химический реактор. Из-за действия молнии во время шторма образуются оксиды азота NO и NO 2 , обычно называемые NO x .
Эти электрические разряды, наблюдаемые как вспышки молнии, создают условия с высокими температурами (30 000 o C) и высоким давлением, которые способствуют химическому соединению кислорода O 2 и азота N 2 из атмосферы с образованием оксидов азота NO x .
Этот механизм имеет очень низкий уровень вклада в общую скорость азотфиксации, но он является наиболее важным среди абиотических форм.
Сжигает ископаемое топливо
Существует антропогенный вклад в образование оксидов азота. Мы уже говорили, что прочная тройная связь молекулы азота N 2 может быть разорвана только в экстремальных условиях.
Сжигание ископаемого топлива, полученного из нефти (в промышленности, на коммерческом и частном транспорте, на море, в воздухе и на суше), вызывает огромные выбросы NO x в атмосферу.
N 2 O, выделяемый при сгорании ископаемого топлива, является мощным парниковым газом, который способствует глобальному потеплению на планете.
Сжигание биомассы
Существует также вклад оксидов азота NO x из- за сжигания биомассы в зоне с самой высокой температурой пламени, например, при лесных пожарах, использовании дров для отопления и приготовления пищи, сжигании органических мусора и любом использовании биомассы в качестве источника калорийная энергия.
Оксиды азота NOx, выбрасываемые в атмосферу антропогенными путями, вызывают серьезные проблемы загрязнения окружающей среды, такие как фотохимический смог в городской и промышленной среде, и вносят важный вклад в кислотные дожди.
Выбросы азота в результате эрозии почвы и выветривания горных пород
Эрозия почвы и выветривание богатых азотом коренных пород подвергают минералы воздействию элементов, которые могут выделять оксиды азота. Выветривание коренных пород происходит из-за воздействия факторов окружающей среды, вызванных взаимодействием физических и химических механизмов.
Тектонические движения могут физически подвергать богатые азотом горные породы воздействию элементов. Впоследствии, химическим путем выпадение кислотных дождей вызывает химические реакции, в результате которых выделяется NO x как из этого типа горных пород, так и из почвы.
Согласно недавним исследованиям, 26% общего биодоступного азота планеты связаны с этими механизмами эрозии почвы и выветривания горных пород.
Биотические формы азотфиксации
У некоторых бактериальных микроорганизмов есть механизмы, способные разорвать тройную связь N 2 и произвести аммиак NH 3 , который легко превращается в ион аммония, метаболизируемый NH 4 + .
Свободноживущие или симбиотические микроорганизмы
Формы фиксации азота микроорганизмами могут происходить через свободноживущие организмы или через организмы, которые живут в симбиотических ассоциациях с растениями.
Хотя между азотфиксирующими микроорганизмами существуют большие морфологические и физиологические различия, процесс фиксации и ферментная система нитрогеназы, используемые всеми ними, очень похожи.
В количественном отношении биотическая фиксация азота посредством этих двух механизмов (свободная жизнь и симбиоз) является наиболее важной во всем мире.
Механизмы поддержания активности нитрогеназной системы
У азотфиксирующих микроорганизмов есть стратегические механизмы, поддерживающие активность ферментативной системы нитрогеназы.
Эти механизмы включают респираторную защиту, конформационную химическую защиту, обратимое ингибирование активности фермента, дополнительный синтез альтернативной нитрогеназы с ванадием и железом в качестве кофакторов, создание диффузионных барьеров для кислорода и пространственное разделение нитрогеназа.
Некоторые из них имеют микроаэрофилию, например хемотрофные бактерии родов Azospirilium, Aquaspirillum, Azotobacter, Beijerinkia, Azomonas, Derxia, Crynebacterium, Rhizobium, Agrobacterium, Thiobacillus, и фототрофы из родов Gleocapcirilia, Sporia, Sporia, Sporia, Sporia, Sporia, Sporia, Sporia, SpyLeocapsa.
Другие представляют факультативный анаэробиоз, например, хемотрофные роды: Klebsiella, Citrobacter, Erwinia, Bacillus, Propionibacterium и фототрофы из родов Rhodospirillum, Rhodopsuedomonas.
Биотическая азотфиксация свободноживущими микроорганизмами
Азотфиксирующие микроорганизмы, обитающие в почве в свободной (асимбиотической) форме, в основном представляют собой архебактерии и бактерии.
Существует несколько типов бактерий и цианобактерий, которые могут преобразовывать атмосферный азот, N 2, в аммиак, NH 3 . По химической реакции:
N 2 + 8H + + 8e - +16 АТФ → 2 NH 3 + H 2 +16 АДФ + 16Pi
Эта реакция требует посредничества ферментной системы нитрогеназы и кофактора, витамина B 12 . Кроме того, этот механизм фиксации азота потребляет много энергии, является эндотермическим и требует 226 ккал / моль N 2 ; то есть он несет высокую метаболическую стоимость, поэтому его необходимо соединить с системой, производящей энергию.
Энергия, необходимая для реакции N-фиксации
Энергия для этого процесса получается из АТФ, который происходит в результате окислительного фосфорилирования, связанного с цепью переноса электронов (которая использует кислород в качестве конечного акцептора электронов).
Процесс восстановления молекулярного азота до аммиака также восстанавливает водород в протонной форме H + до молекулярного водорода H 2.
Многие системы нитрогеназы связаны с системой рециркуляции водорода, опосредованной ферментом гидрогеназы. Цианобактерии, связывающие азот, связывают фотосинтез с азотфиксацией.
Ферментный комплекс нитрогеназа и кислород
Комплекс ферментов нитрогеназы состоит из двух компонентов: компонент I, динитрогеназа с молибденом и железом в качестве кофакторов (который мы будем называть Mo-Fe-белком), и компонент II, динитрогеназа-редуктаза с железом в качестве кофактора (Fe-белок).
Электроны, участвующие в реакции, сначала передаются компоненту II, а затем компоненту I, где происходит восстановление азота.
Чтобы произошел перенос электронов от II к I, необходимо, чтобы Fe-белок связывался с Mg-ATP в двух активных центрах. Это объединение вызывает конформационные изменения в Fe-белке. Избыток кислорода может вызвать еще одно неблагоприятное конформационное изменение в Fe-белке, поскольку он отменяет его способность принимать электроны.
Вот почему ферментный комплекс нитрогеназы очень чувствителен к присутствию кислорода в концентрациях, превышающих допустимые, и что у некоторых бактерий развиваются микроаэрофильные формы жизни или факультативный анаэробиоз.
Среди свободноживущих азотфиксирующих бактерий можно упомянуть хемотрофов, принадлежащих к родам Clostridium, Desulfovibrio, Desulfotomaculum, Methanosarcina, а также фототрофов родов Chromatium, Thiopedia, Ectothiordospira и других.
Биотическая азотфиксация микроорганизмами симбиотической жизни с растениями
Существуют и другие азотфиксирующие микроорганизмы, которые способны устанавливать симбиотические ассоциации с растениями, особенно с бобовыми и травами, либо в форме эктосимбиоза (когда микроорганизм находится вне растения), либо в виде эндосимбиоза (когда микроорганизм живет в клетках или межклеточных пространствах растения).
Основная часть азота, фиксируемого в наземных экосистемах, поступает из симбиотических ассоциаций бактерий родов Rhizobium, Bradyrhizobium, Sinorhizobium, Azorhizobium, Allorhizoium и Mesorhizobium с бобовыми растениями.
Существует три интересных типа азотфиксирующих симбиозов: ассоциативные ризоценозы, системы с цианобактериями в качестве симбионтов и мутуалистические эндоризобиозы.
Rhizocenosis
При ассоциативных ризоценозоподобных симбиозах в корнях растений не образуются специализированные структуры.
Примеры этого типа симбиоза установлены между растениями кукурузы (Zea maiz) и сахарного тростника (Saccharum officinarum) с Gluconacetobacter, Azoarcus, Azospirillum и Herbaspirillum.
В ризоценозе азотфиксирующие бактерии используют корневой экссудат растения в качестве питательной среды и колонизируют межклеточные пространства коркового вещества корня.
Симбиотические цианобактерии
В системах, в которых участвуют цианобактерии, эти микроорганизмы разработали особые механизмы сосуществования бескислородной азотфиксации и их кислородного фотосинтеза.
Например, у Gleothece и Synechococcus они временно разделяются: они выполняют дневной фотосинтез и ночную азотфиксацию.
В других случаях наблюдается пространственное разделение обоих процессов: азот фиксируется в группах дифференцированных клеток (гетероцист), где фотосинтез не происходит.
Азотфиксирующие симбиотические ассоциации цианобактерий рода Nostoc были изучены с несосудистыми растениями (antóceras), такими как в полостях Nothocerus endiviaefolius, с печеночниками Gakstroemia magellanica и Chyloscyphus obvolutus при эктосимбиозе отдельно (с ризофитами, образующими ризофиты). и с высшими покрытосеменными растениями, например с 65 многолетними травами рода Gunnnera.
Например, симбиотическая азотфиксирующая ассоциация цианобактерий Anabaena с мохообразным, несосудистым растением, наблюдалась в листьях небольшого папоротника Azolla anabaenae.
Endorhizobiosis
В качестве примеров эндоризобиоза мы можем привести ассоциацию, называемую актинориза, которая устанавливается между Frankia и некоторыми древесными растениями, такими как казуарина (Casuarina cunninghamiana) и ольха (Alnus glutinosa), а также ассоциацию Rhizobium-бобовых.
Большинство видов семейства Leguminosae образуют симбиотические ассоциации с бактериями Rhizobium, и этот микроорганизм имеет эволюционную специализацию в передаче азота растению.
В корнях растений, связанных с Rhizobium, появляются так называемые радикальные клубеньки, где происходит азотфиксация.
У бобовых культур Sesbania и Aechynomene на стеблях образуются дополнительные клубеньки.
- Химические сигналы
Между симбионтом и хозяином происходит обмен химическими сигналами. Было обнаружено, что растения выделяют определенные типы флавоноидов, которые вызывают экспрессию nod-генов у Rhizobium, которые продуцируют факторы клубеньков.
Факторы клубеньков вызывают модификации корневых волосков, формирование канала инфекции и деление клеток в коре корня, которые способствуют образованию узелка.
Некоторые примеры азотфиксирующего симбиоза между высшими растениями и микроорганизмами показаны в следующей таблице.
Mycorrhizobiosis
Кроме того, в большинстве экосистем есть азотфиксирующие микоризные грибы, принадлежащие к типам Glomeromycota, Basidiomycota и Ascomycota.
Микоризные грибы могут жить в условиях эктосимбиоза, образуя гифальную оболочку вокруг тонких корней некоторых растений и распространяя дополнительные гифы по почве. Также во многих тропических регионах растения являются переносчиками микоризы при эндосимбиозе, гифы которой проникают в клетки корня.
Не исключено, что гриб образует микоризы одновременно с несколькими растениями, и в этом случае между ними устанавливаются взаимосвязи; или что микоризный гриб паразитирован растением, которое не фотосинтезирует, микогетеротрофным, таким как растения из рода Monotropa. Также несколько грибов могут одновременно вступать в симбиоз с одним растением.
Ссылки
- Иномура, К. , Брэгг, Дж. И Фоллоус, М. (2017). Количественный анализ прямых и косвенных затрат на азотфиксацию. Журнал ISME. 11: 166-175.
- Массон-Бовин, К. и Сакс, Дж. (2018). Симбиотическая азотфиксация ризобиями - корни истории успеха. Биология растений. 44: 7-15. DOI: 10.1016 / j.pbi.2017.12.001
- Менге, DNL, Левин, С.А. и Хедин, Л.О. (2009). Факультативные и облигатные стратегии азотфиксации и их последствия для экосистемы. Американский натуралист. 174 (4) DOI: 10.1086 / 605377
- Ньютон, WE (2000). Фиксация азота в перспективе. В: Педроса, редактор FO. Связывание азота с молекул для повышения урожайности сельскохозяйственных культур. Нидерланды: Kluwer Academic Publishers. 3-8.
- Pankievicz; VCS, сделай Амарал; Ф.П., Сантос, КДН, Агтука, Б., Сюй, Ю., Шультес, MJ (2015). Устойчивая биологическая фиксация азота в модельной ассоциации злаков и бактерий. Заводской журнал. 81: 907-919. DOI: 10.1111 / tpj.12777.
- Видер, В. Р., Кливленд, С. К., Лоуренс, Д. и Бонау, Великобритания (2015). Влияние структурной неопределенности модели на прогнозы углеродного цикла: биологическая фиксация азота как пример исследования. Письма об экологических исследованиях. 10 (4): 1-9. DOI: 10.1088 / 1748-9326 / 10/4/044016